2002年為貫徹同濟大學和南匯區人民政府簽署的《面向二十一世紀全面合作協議書》的精神，按照上海同濟南匯科技產業園“科技成果的轉化基地、科技企業的孵化基地、科技人才的培養基地、創新工程的實驗基地”的發展宗旨，上海南方科技專修學院在同濟南匯科技產業園教培研發基地應運而生，是經上海市人民政府批準成立的以培養高級應用型高端人才為主的高等教育院校，學院多次被教育部門評為優秀院校，2013年又獲“全國高等教育優秀特色院?！狈Q號。

學院“學歷+技能”是在上海率先實行“2+4”的教學模式 ，初中畢業直升大專。招收全國初中畢業生，無戶籍限制。前兩年學習高中課程，后四年學習“專本套讀”課程，學業期滿頒發國家教育部統一印制的《高等學校學歷證書》，此學歷為國家承認的教育部官網—學信網可查的大專學歷。讀大專的同時可以同時進行本科段的學習，成績合格者可以獲得一專一本兩張學歷。

上海南方科技專修學院以培養社會急需的人才為目標，同時對學生進行職業技術培訓，成績合格可獲得所從事職業的初級、中級、高級職業資格證書。學歷+技能班已連續舉辦多屆，大學98%上線率。經過這多年的發展，教學管理逐步完善，教育質量穩步提升，學生管理更為科學，學生成績不斷提高，就業渠道暢通，就業崗位廣泛，越來越受到廣大學生及家長的歡迎，就業也成為了上海南方科技專修學院的一大特色。